截至2022年3月，郑州大学有“双一流”建设学科3个，国家重点学科2个，国家重点（培育）学科4个，有31个一级学科博士学位授权点、4个博士专业学位授权点，59个一级学科硕士学位授权点、34个硕士专业学位授权点、有28个博士后科研流动站 。第八批一级学科河南省重点学科46个，第八批二级学科河南省重点学科4个。
截止2022年7月，郑州大学共有ESI世界排名前1‰学科3个：化学、材料科学和临床医学；ESI世界排名前1%学科14个：临床医学、化学、材料科学、工程学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学、神经科学与行为学、免疫学、环境与生态学、物理学、社会科学、计算机学、农业科学。
省重点一级学科：应用经济学、法学、马克思主义理论、体育学、中国语言文学、外国语言文学、新闻传播学、考古学、中国史、世界史、数学、物理学、化学、生物学、生态学、统计学、力学、机械工程、光学工程、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、建筑学、土木工程、水利工程、化学工程与技术、交通运输工程、核科学与技术、环境科学与工程、城乡规划学、软件工程、安全科学与工程、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、护理学、管理科学与工程、公共管理、图书情报与档案管理、音乐与舞蹈学
2017年12月28日，教育部公布全国第四轮学科评估结果。郑州大学共有43个参评学科上榜，在全国高校排名第13。其中，7个学科进入B+类学科：马克思主义理论、考古学、化学、材料科学与工程、水利工程、化学工程与技术、公共管理，全国排位前10%—20%；7个学科进入B类学科：法学、新闻传播学、数学、土木工程、软件工程、临床医学、药学，全国排位前20%—30%。
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